1934年9月，中央軍委指示紅25軍主力作戰(zhàn)略轉(zhuǎn)移，去創(chuàng)建新的根據(jù)地。鄭位三為了盡快實(shí)現(xiàn)這一戰(zhàn)略決策，當(dāng)即寫信給活動(dòng)在皖西的鄂豫皖省委和紅25軍，說(shuō)明了這一情況。鄂豫皖省委在光山縣花山寨，做出了紅25軍實(shí)行戰(zhàn)略轉(zhuǎn)移的決定，整編了部隊(duì)，由時(shí)任省委常委兼秘書長(zhǎng)的鄭位三任軍政治部主任，隨軍長(zhǎng)征。

　　鄭位三生活儉樸，作風(fēng)扎實(shí)，平易近人。他時(shí)常穿著一身破舊衣服，在紅25軍中，大家都親切地稱他“位老”，其實(shí)他那時(shí)只有33歲。

　　鄭位三過(guò)去一直做地方工作，對(duì)搞農(nóng)民運(yùn)動(dòng)、建立地方政權(quán)、堅(jiān)持游擊戰(zhàn)爭(zhēng)，都有著豐富的經(jīng)驗(yàn)。在紅軍中做政治工作，他還是第一次。但他堅(jiān)決服從組織的決定，以堅(jiān)定的信念、認(rèn)真的態(tài)度、求實(shí)的精神去熟悉新的工作。他善于發(fā)揚(yáng)民主，集思廣益。他經(jīng)常把政治部的同志召集起來(lái)，共同商量研究，很快就熟悉了軍隊(duì)中的政治工作。長(zhǎng)征路上，他很少騎馬，經(jīng)常拄著一根木棍，跟連隊(duì)一起行軍。部隊(duì)每到一地，他就跟戰(zhàn)士擠在一起，親親熱熱地拉家常。有時(shí)還給戰(zhàn)士講上幾段故事，既風(fēng)趣，又幽默。所以，基層干部戰(zhàn)士都愿意和他接近。他給部隊(duì)上政治課，聯(lián)系實(shí)際，深入淺出。比如，長(zhǎng)征出發(fā)前，他曾從書上找了一張列寧像，讓劉華清臨摹放大，掛在墻上。他首先從列寧講起，講到十月革命的成功，使戰(zhàn)士從十月革命的勝利，看到了中國(guó)革命的前途，堅(jiān)定了革命的信念。

　　1934年12月10日，紅25軍進(jìn)入陜南商洛地區(qū)，中共鄂豫陜省委決定在鄂豫陜邊創(chuàng)建新蘇區(qū)。為讓新區(qū)人民了解紅軍，部隊(duì)一進(jìn)入陜南，鄭位三就起草了《什么是紅軍》的張貼傳單。僅以四百來(lái)字，就把紅軍的宗旨、性質(zhì)、任務(wù)以及有關(guān)政策講得十分明確。紅25軍攻占鎮(zhèn)安縣城后，他又起草了《中國(guó)工農(nóng)紅軍第二十五軍為占領(lǐng)鎮(zhèn)安縣告群眾書》。他還根據(jù)省委有關(guān)新蘇區(qū)的經(jīng)濟(jì)政策，起草了《關(guān)于商業(yè)政策》的布告。為爭(zhēng)取瓦解國(guó)民黨士兵，他起草了《告國(guó)民黨士兵書》。為做好新蘇區(qū)優(yōu)待紅軍家屬工作，他制定了“紅軍家屬優(yōu)待證”，并親筆給部分戰(zhàn)士簽發(fā)。鄭位三起草和制定的這些有著歷史意義的文獻(xiàn)，在紅25軍開創(chuàng)鄂豫陜蘇區(qū)的過(guò)程中，曾產(chǎn)生過(guò)深遠(yuǎn)的影響。

　　1935年7月，紅25軍為配合中央紅軍的北上，決定西征甘肅、北上陜北。當(dāng)時(shí)，擔(dān)任鄂陜特委書記的鄭位三被留在陜南地區(qū)，繼續(xù)堅(jiān)持鄂豫陜根據(jù)地的游擊戰(zhàn)爭(zhēng)。紅軍主力北上后，敵人仍集中20多個(gè)團(tuán)的兵力，對(duì)鄂豫陜革命根據(jù)地實(shí)行“劃區(qū)清剿”，妄圖消滅留在鄂豫陜根據(jù)地的游擊武裝。在此危難時(shí)刻，鄭位三召開聯(lián)席會(huì)議，將鄂陜、豫陜兩個(gè)特委合并成鄂豫陜特委，將留下的紅軍和游擊武裝編成紅74師，由他任特委書記，陳先瑞任師長(zhǎng)。由于統(tǒng)一了領(lǐng)導(dǎo)，集中了兵力，使鄂豫陜邊的游擊戰(zhàn)爭(zhēng)有了可靠保證。隨后，鄭位三冷靜地分析形勢(shì)，準(zhǔn)確地判斷敵情，決定避敵鋒芒，揚(yáng)我之長(zhǎng)，采取“兜大圈子”的游擊戰(zhàn)法，從敵人的包圍中奔來(lái)突去，忽東忽西，神出鬼沒(méi)，先后打破敵人三次“圍攻”。

　　根據(jù)這一方針，紅74師大膽而靈活地開展游擊戰(zhàn)爭(zhēng)。一次在鎮(zhèn)安縣青銅關(guān)，我軍利用有利地形，伏擊了敵40軍230團(tuán)一個(gè)營(yíng)。接著，聲東擊西，襲占了佛坪縣城（袁家莊）。敵人跟蹤而至，我軍又一舉打出秦嶺，當(dāng)西安、寶雞之?dāng)硣鷣?lái)時(shí)，遂又進(jìn)入山中，第二次占領(lǐng)佛坪縣城。

　　1936年秋，敵人又一次調(diào)集重兵進(jìn)行“圍剿”。特委根據(jù)山區(qū)地形條件和我軍善于游擊的長(zhǎng)處，決定將部隊(duì)“化整為零”，深入敵后活動(dòng)。鄭位三當(dāng)時(shí)領(lǐng)導(dǎo)一團(tuán)，出商洛，奔襲兩岔河，回兵大龍廟，橫掃反動(dòng)民團(tuán)，捕捉了由西安赴商州上任的國(guó)民黨督察專員湯有光。不久，他又根據(jù)敵情變化，提出集中兵力打擊敵人。部隊(duì)集中后，在商南縣富水關(guān)痛擊了公秉藩?jiǎng)e動(dòng)隊(duì)一個(gè)大隊(duì)，接著揮師北上，在華山腳下轉(zhuǎn)了三個(gè)大圈，繼而進(jìn)入藍(lán)田境內(nèi)，對(duì)西安之?dāng)痴饎?dòng)很大。

　　因?yàn)闆](méi)有電臺(tái)聯(lián)絡(luò)，紅74師完全和上級(jí)黨組織失去聯(lián)系，對(duì)當(dāng)時(shí)的斗爭(zhēng)形勢(shì)很不了解。在這種情況下，鄭位三想了許多辦法。他走一路問(wèn)一路，及時(shí)了解敵情動(dòng)態(tài)，熟悉地形道路。他還從各種報(bào)紙和截獲的敵偽信件中判斷敵情，決定部隊(duì)行動(dòng)。紅74師打下寧陜縣城后，他根據(jù)周圍的敵情分布和路程遠(yuǎn)近，決定部隊(duì)就地休整八天，開展群眾工作。當(dāng)部隊(duì)撤離后，敵人果然在第九天進(jìn)入寧陜縣城。

　　鄭位三在領(lǐng)導(dǎo)陜南的游擊戰(zhàn)爭(zhēng)中，還依據(jù)斗爭(zhēng)的需要和形勢(shì)的變化，靈活地制定和實(shí)行了一些具體政策。例如，對(duì)在寧陜、柞水一帶活動(dòng)的宋登賢“神團(tuán)”組織，他主動(dòng)派人去做工作，從武器、經(jīng)費(fèi)上給以資助，最后把這支農(nóng)民武裝編為紅74師補(bǔ)充團(tuán)。對(duì)當(dāng)時(shí)率部起義的何振亞、沈啟賢同志，他親自寫信聯(lián)系，同何部派來(lái)的人親切交談，使這支部隊(duì)加入了紅軍的隊(duì)伍。對(duì)商南縣大地主石老八，不捕不殺，不沒(méi)收其財(cái)產(chǎn)，利用其為我軍采購(gòu)藥品、布匹等物資。柞水縣的一名偽區(qū)長(zhǎng)，經(jīng)過(guò)鄭位三幾次教育后，明著為敵人辦事，暗地給我軍送情報(bào)、籌糧款、掩護(hù)傷員。我軍曾多次截獲過(guò)郵差，鄭位三每次都只準(zhǔn)扣留有關(guān)敵偽方面的信件、報(bào)紙，然后給郵差開個(gè)“收條”，蓋上公章，以宣傳我軍政策，保護(hù)郵遞人員。這些具體政策的貫徹執(zhí)行，有效地分化了敵人，爭(zhēng)取和團(tuán)結(jié)了中間勢(shì)力，使游擊戰(zhàn)爭(zhēng)得以勝利開展。

　　陜南的游擊戰(zhàn)爭(zhēng)是十分艱苦的。部隊(duì)整天翻山越嶺，出沒(méi)在深山密林之中。鄭位三當(dāng)時(shí)就患有嚴(yán)重的十二指腸潰瘍，加之缺醫(yī)少藥，饑一頓飽一頓的，體質(zhì)十分虛弱。同志們出于對(duì)他的關(guān)心，有時(shí)給他搞點(diǎn)肉食，但說(shuō)啥他也要和大家一起吃。鄭位三領(lǐng)導(dǎo)鄂豫陜特委和紅74師，獨(dú)立堅(jiān)持了近兩年的游擊戰(zhàn)爭(zhēng)，使紅74師由原來(lái)的600余人，發(fā)展到2100余人。

　　西安事變爆發(fā)時(shí)，這支活躍在鄂豫陜根據(jù)地的紅軍隊(duì)伍，在周恩來(lái)同志的關(guān)懷下，回到了黨中央的懷抱，后來(lái)改編為留守兵團(tuán)警衛(wèi)四團(tuán)，肩負(fù)起保衛(wèi)陜甘寧邊區(qū)、保衛(wèi)黨中央的光榮任務(wù)。賀龍?jiān)f(shuō)過(guò)：“紅74師能在陜南堅(jiān)持近兩年的游擊戰(zhàn)爭(zhēng)，位三同志的正確領(lǐng)導(dǎo)起了重要作用。”